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张 涛,陈 为,谢利广,胡 敏,彭群生.基于三维数据场拓扑抽取的蛋白质结构分析.软件学报,2006,17(zk):120-125
基于三维数据场拓扑抽取的蛋白质结构分析
Molecular Structural Analysis Based on the Topological Extraction of 3D Scalar Fields
投稿时间:2006-03-15  修订日期:2006-09-11
DOI:
中文关键词:  三维数据场  奇点  轮廓  轮廓树  Morse 函数
英文关键词:3D scalar field  critical point  contour  contour tree  Morse function
基金项目:Supported by the the National Natural Science Foundation of China under Grant Nos.60533050,60503056,60021201 (国家自然科学基金)
作者单位
张 涛 浙江大学 CAD&CG 国家重点实验室浙江 杭州 310027 
陈 为 浙江大学 CAD&CG 国家重点实验室浙江 杭州 310027 
谢利广 浙江大学 CAD&CG 国家重点实验室浙江 杭州 310027 
胡 敏 浙江大学 CAD&CG 国家重点实验室浙江 杭州 310027 
彭群生 浙江大学 CAD&CG 国家重点实验室浙江 杭州 310027 
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中文摘要:
      介绍了抽取蛋白质分子三维数据场的局部特征,并组织数据场的整体拓扑的初步工作.基于拓扑分析的方法,计算出数据场的局部特征点,这些特征点潜在地揭示了蛋白质的活性位点.在此基础上,利用这些局部特征点构造出表示数据场的几何拓扑结构.将实验结果与实际的蛋白质数据比较,验证了方法的可行性.
英文摘要:
      In this paper, efforts on extracting local features and building the global topology of 3D macromolecular scalar field are introduced.Base on the topological analysis,the critical points which potentially indicate the active regions are calculated.This technique is employed to construct the topolog ical and geometrical structures of the scalar field.The preliminary experiments with the protein data sets verify the feasibility of the method.
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